O corte de verbas federais no estado não atinge só a infraestrutura. Também houve remanejamento no Ministério da Educação, impactando no custeio de despesas básicas de universidades e institutos federais. A UFSC e o IFSC informaram que, juntos, mais de R$ 5 milhões foram bloqueados. 

As instituições já tinham sofrido com cortes em junho. Segundo a UFSC, o novo bloqueio deixará dez mil alunos em bolsas e contas de água e luza não serão pagas. O IFSC também se manifestou, destacando que o corte prejudica o pagamento de bolsas e custeio de alimentação, internet e transporte, além de serviços de limpeza e segurança.

O governo federal alega que se trata de bloqueios orçamentários e não de cortes de repasses, em medida para atender o teto de gastos, com previsão de recompor o montante em dezembro.